Первая матрица круче второй и третей части?

По моему убеждению да. Первая матрица, кроме новаторских спецэффектов имеет динамично развивающийся сюжет, раскрывает философскую суть, которая отображает, что все наши ощущения и убеждения, всего лишь наше восприятие происходящего.

Две последующие больше серии больше напоминают клип из спецэффектов, использующий уже озвученную в первой части идею, и эффекты. Сюжет топчится на месте, без какого либо развития.